空間管理有序、有效、自動化
有序的空間管理是生物樣本庫信息化管理的初衷。當樣本量積累到一定程度時，手工管理會變得很凌亂，極易造成錯誤。在這種情況下，應用條形碼等技術，可以準確定位每個樣本，使空間管理自動化。同時，空間的信息化管理可以合理有效地規劃儲存空間，大大提高空間的利用率。
流程管理實時、自動化、可追蹤
在樣本的收集、處理、出入庫等操作流程中，應用條形碼、RFID等技術，在樣本庫信息系統可以準確了解樣本的狀態，使管理自動化，并可以追蹤樣本在流程中的痕跡，記錄流程執行人員的操作。
臨床（表型）數據完整、準確翔實
樣本相關臨床數據的管理是生物樣本庫信息管理中最終的部分。沒有可靠、較完整的臨床數據，樣本的價值是非常有限的。臨床數據復雜多樣，針對不同的科室或疾病，臨床數據收集的形式和內容會有所不同。但原則上，一定要保證數據的準確性和完整性?？赏ㄟ^與醫院已有信息管理系統的鏈接，導入所需的數據，保證數據的完整性和準確性。
數據查詢、樣本檢索快速便捷
生物樣本庫信息管理系統應提供簡便的查詢與檢索功能，能夠快速準確地找到用戶所需要的樣本的相關數據。查詢應提供多字段查找，可以從樣本本身和相關數據檢索，特別是可根據任意臨床數據字段及字段組合進行查找。
保障數據安全、保護個人隱私
數據安全是生物樣本庫信息管理中的重要部分，其包括兩個方面。一方面是數據不能丟失、毀壞，這需要有較好的數據備份系統和防止惡意侵入；另一方面是防止數據在非授權的情況下，被獲取、改動或泄露，特別是個人隱私數據。這就要求生物樣本庫信息系統有較完善的權限管理功能和操作記錄功能，可追蹤數據操作中的每一步。
